RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	ENPP3	O14638	875 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	INSRR	P14616	1297 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	RTN1	Q16799	776 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	BANK1	Q8NDB2	785 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	PGBD1	Q96JS3	809 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	NFASC	O94856	1347 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	ZBTB43	O43298	467 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	AR	P10275	920 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	SKAP1	Q86WV1	359 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	SDF4	Q9BRK5	362 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	TRPC6	Q9Y210	931 aa		18.34	■□□□□ 0.53
DDX11-222	ENST00000542777	SMCO2	A6NFE2	343 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RB1	P06400	928 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CTNNB1	P35222	781 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ADCY7	P51828	1080 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ACTR2	P61160	394 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FUT2	Q10981	343 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PLCB4	Q15147	1175 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CEP55	Q53EZ4	464 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IER5	Q5VY09	327 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RASEF	Q8IZ41	740 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ANO3	Q9BYT9	981 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CD320	Q9NPF0	282 aa		18.33	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	STXBP3	O00186	592 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IL9	P15248	144 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CD52	P31358	61 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	BMPR1A	P36894	532 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	STAT5B	P51692	787 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM260	Q9NX78	707 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	BARHL2	Q9NY43	387 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TTC3	P53804	2025 aa		18.32	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777		M0QZ92	97 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	MEIS1	O00470	390 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF76	P36508	570 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	NEK9	Q8TD19	979 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		18.31	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	POTEB3	A0JP26	581 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	DGKI	O75912	1065 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ATG7	O95352	703 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00271	P0C7V0	271 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CDC27	P30260	824 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SREBF1	P36956	1147 aa		18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
DDX11-222	ENST00000542777	AP3B2	Q13367	1082 aa		18.3	■□□□□ 0.52

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