RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502715.1

UBE2CP3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP3, Length 450 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP3-201ENST00000502715 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 TTC41PQ6P2S7 1318 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 RPTORQ8N122 1335 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 A0A0G2JMZ2 1700 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CFAP69A5D8W1 941 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SLC15A5A6NIM6 579 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SMIM22K7EJ46 135 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 MMP20O60882 483 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 TFRCP02786 760 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 S100BP04271 92 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 HOXC6P09630 235 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 AKR1B1P15121 316 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 NFKB1P19838 968 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CYP2B6P20813 491 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 FGFR3P22607 806 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 RGS2P41220 211 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CDK8P49336 464 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 TBX4P57082 545 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CCNA1P78396 465 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 PLAURQ03405 335 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 ICA1Q05084 483 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 HYAL2Q12891 473 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 GRB14Q14449 540 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 COG2Q14746 738 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 PCSK7Q16549 785 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SBK1Q52WX2 424 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CTR9Q6PD62 1173 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CCDC174Q6PII3 467 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SV2AQ7L0J3 742 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 PLEKHH3Q7Z736 793 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 RPAINQ86UA6 219 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 DRC7Q8IY82 874 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 MB21D1Q8N884 522 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 APPBP2Q92624 585 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 OSBP2Q969R2 916 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 DYNLL2Q96FJ2 89 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SPACA7Q96KW9 195 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 LNPKQ9C0E8 428 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 PRO3102Q9H379 93 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 C12orf49Q9H741 205 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SH2D4AQ9H788 454 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 VCPKMTQ9H867 229 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 NPHS2Q9NP85 383 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 BTBD7Q9P203 1132 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 FAM8A1Q9UBU6 413 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 OGDHLQ9ULD0 1010 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 TMX2Q9Y320 296 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SCINQ9Y6U3 715 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZNF236Q9UL36 1845 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 RLFQ13129 1914 aa4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 DNAH12Q6ZR08 3092 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CDC14CA4D256 554 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 ERC2O15083 957 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 GPAA1O43292 621 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 PRC1O43663 620 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 EEF2P13639 858 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 GNAT2P19087 354 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CD33P20138 364 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 MTA1Q13330 715 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CCL14Q16627 93 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 NECAB2Q7Z6G3 386 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 NCAPG2Q86XI2 1143 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.49□□□□□ -1.69
UBE2CP3-201ENST00000502715 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms