RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496043.5

PTPRF-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRF, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-214ENST00000496043 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 NID2Q14112 1375 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 LCHNA4D1U4 455 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ARHGEF15O94989 841 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 CHRNA1P02708 482 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 IGBP1P78318 339 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 PLCB4Q15147 1175 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TRPC6Q9Y210 931 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 EPOPA6NHQ4 379 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 FAM86B1E9PN63 330 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 PPFIA3O75145 1194 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 SLC26A2P50443 739 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ERVK-21P61565 698 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 IER5Q5VY09 327 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TOP1MTQ969P6 601 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 THEGQ9P2T0 379 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 POTEB3A0JP26 581 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 LINC01553A4QN01 128 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 CPLX1O14810 134 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 BACH1O14867 736 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ADAMTS3O15072 1205 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 UPP2O95045 317 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 NLRP5P59047 1200 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MGAT3Q09327 533 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 GRB10Q13322 594 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 POTEBQ6S5H4 581 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 NME8Q8N427 588 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 LMCD1Q9NZU5 365 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 GBF1Q92538 1859 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 HBP1O60381 514 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 CCNE2O96020 404 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 GHRP10912 638 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 CIITAP33076 1130 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 USP11P51784 963 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 LPIN1Q14693 890 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ASB2Q96Q27 587 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 YME1L1Q96TA2 773 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF302Q9NR11 478 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 SQORQ9Y6N5 450 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 KAT6AQ92794 2004 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 M0QZ92 97 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ENPP3O14638 875 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 KLRC1P26715 233 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 PRR16Q569H4 304 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms