RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490753.1

NOP56-215, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP56, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP56-215	ENST00000490753	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	GRM4	Q14833	912 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	IER5L	Q5T953	404 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PLVAP	Q9BX97	442 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	TMEM221	A6NGB7	291 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753		M0R296	226 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	CYTH3	O43739	400 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	DGKI	O75912	1065 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	EYA4	O95677	639 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	GLP2R	O95838	553 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	DNAJB1	P25685	340 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PTPN5	P54829	565 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	ADAM15	Q13444	863 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	P2RX5	Q93086	422 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	IL25	Q9H293	177 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	CLEC1B	Q9P126	229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	ENPP3	O14638	875 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	IGHD	P01880	384 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	ITGB1	P05556	798 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	MARK3	P27448	753 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	TCF15	Q12870	199 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	TRAF1	Q13077	416 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PPFIA1	Q13136	1202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	GRIK4	Q16099	956 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	CD52	P31358	61 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	ZXDA	P98168	799 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	COASY	Q13057	564 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	RSPH3	Q86UC2	560 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP56-215	ENST00000490753	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	HIP1	O00291	1037 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	KCNA2	P16389	499 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	NRIP1	P48552	1158 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	PRRX2	Q99811	253 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	MEIS2	O14770	477 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	ST18	O60284	1047 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	ATP9A	O75110	1047 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	GATM	P50440	423 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	IGBP1	P78318	339 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	TROAP	Q12815	778 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP56-215	ENST00000490753	PKN1	Q16512	942 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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