RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490476.1

SSX2IP-208, Transcript of SSX family member 2 interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene SSX2IP, Length 716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IP-208ENST00000490476 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.5□□□□□ -1.37
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SSX2IP-208ENST00000490476 CD96P40200 585 aa6.47□□□□□ -1.37
SSX2IP-208ENST00000490476 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SSX2IP-208ENST00000490476 IKZF1Q13422 519 aa6.47□□□□□ -1.37
SSX2IP-208ENST00000490476 LSAMPQ13449 338 aa6.47□□□□□ -1.37
SSX2IP-208ENST00000490476 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SSX2IP-208ENST00000490476 TMEM177Q53S58 311 aa6.47□□□□□ -1.37
SSX2IP-208ENST00000490476 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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