RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3-208ENST00000486404 MYLIPQ8WY64 445 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 ZNF576Q9H609 170 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.63□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 ADAMTS3O15072 1205 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 EFCAB14O75071 495 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 LGR5O75473 907 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CXCL10P02778 98 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 NEK4P51957 841 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 RABGGTBP53611 331 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 MYO9BQ13459 2157 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 GALNT17Q6IS24 598 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 BLIDQ8IZY5 108 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 WASF1Q92558 559 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 VWCEQ96DN2 955 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 UIMC1Q96RL1 719 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.62□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 KIF28PB7ZC32 967 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CCNE2O96020 404 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 SLC26A2P50443 739 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 STAT5BP51692 787 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 KRT76Q01546 638 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 IKBKEQ14164 716 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 TBCKQ8TEA7 893 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 GTF3C6Q969F1 213 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 AIFM3Q96NN9 605 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 ZNF302Q9NR11 478 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 SAMM50Q9Y512 469 aa14.61□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 M0QZ92 97 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CIITAP33076 1130 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 MBTPS1Q14703 1052 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 PLCB4Q15147 1175 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.6□□□□□ -0.07
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CHMP3-208ENST00000486404 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 SEPT8Q92599 483 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 IL17RAQ96F46 866 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 PCYT2Q99447 389 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.6□□□□□ -0.07
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CHMP3-208ENST00000486404 WDR64B1ANS9 1081 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CHMP2AO43633 222 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 TLL1O43897 1013 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 GAS7O60861 476 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 SEC24BO95487 1268 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CA3P07451 260 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 PSAPP07602 524 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 INSRRP14616 1297 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 MYOGP15173 224 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 USP11P51784 963 aa14.59□□□□□ -0.07
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CHMP3-208ENST00000486404 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 POTEBQ6S5H4 581 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 NECAB1Q8N987 351 aa14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CHMP3-208ENST00000486404 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.59□□□□□ -0.07
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CHMP3-208ENST00000486404 GPNMBQ14956 572 aa14.58□□□□□ -0.08
CHMP3-208ENST00000486404 ME3Q16798 604 aa14.58□□□□□ -0.08
CHMP3-208ENST00000486404 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.58□□□□□ -0.08
CHMP3-208ENST00000486404 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.58□□□□□ -0.08
CHMP3-208ENST00000486404 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.58□□□□□ -0.08
CHMP3-208ENST00000486404 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.58□□□□□ -0.08
CHMP3-208ENST00000486404 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.58□□□□□ -0.08
CHMP3-208ENST00000486404 APBB2Q92870 758 aa14.58□□□□□ -0.08
CHMP3-208ENST00000486404 LENG9Q96B70 501 aa14.58□□□□□ -0.08
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