RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ERBB4Q15303 1308 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGGTB-209ENST00000473406 SCDO00767 359 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 NPHS1O60500 1241 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 FKTNO75072 461 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFS2O75306 463 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D8O95759 1140 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 COL6A2P12110 1019 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-209ENST00000473406 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-209ENST00000473406 FIGNQ5HY92 759 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 PGBD4Q96DM1 585 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGGTB-209ENST00000473406 FNIP2Q9P278 1114 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BML4 177 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 TUSC2O75896 110 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 BMP3P12645 472 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 BDNFP23560 247 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC9A5Q14940 896 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 NFKBIBQ15653 356 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CPZQ66K79 652 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 PAOXQ6QHF9 649 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP68Q76N32 757 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 PCGF5Q86SE9 256 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 DENND1CQ8IV53 801 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX19Q8NA77 164 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 DLG3Q92796 817 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 MVB12AQ96EY5 273 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SGCZQ96LD1 299 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC138Q96M89 665 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 RSAD1Q9HA92 442 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 IPPQ9Y573 584 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 DTNBO60941 627 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMA5AQ13591 1074 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CT83Q5H943 113 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 USP45Q70EL2 814 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8N1Y9 231 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 DPF3Q92784 378 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 MYRFLQ96LU7 910 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC2A13Q96QE2 648 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF69Q9UC07 566 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SWAP70Q9UH65 585 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 USP21Q9UK80 565 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GALT2O43825 422 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCP20941 246 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 FPR2P25090 351 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 BIRC3Q13489 604 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-209ENST00000473406 EPHA7Q15375 998 aa7.43□□□□□ -1.22
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