RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 ESYT2A0FGR8 921 aa23.79■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 MEIS1O00470 390 aa23.79■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.79■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.79■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 COG5Q9UP83 839 aa23.79■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.79■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 TNFRSF10AO00220 468 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 ARP10275 920 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 CPA1P15085 419 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 AAK1Q2M2I8 961 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 RSPH3Q86UC2 560 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SDF4Q9BRK5 362 aa23.78■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SCG2P13521 617 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 ACTR2P61160 394 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 FGD1P98174 961 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 TFF2Q03403 129 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 APOBRQ0VD83 1088 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 Q6ZUG5 572 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 BRF1Q92994 677 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 AZI2Q9H6S1 392 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM260Q9NX78 707 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.77■■□□□ 1.4
UBXN4-204ENST00000426921 NCOR1O75376 2440 aa23.76■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 ATG7O95352 703 aa23.76■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 BMP1P13497 986 aa23.76■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 INSRRP14616 1297 aa23.76■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 IL27Q8NEV9 243 aa23.76■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 SAMD11Q96NU1 681 aa23.76■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.76■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.75■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 GHRP10912 638 aa23.75■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 RPS6KB1P23443 525 aa23.75■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 LPIN1Q14693 890 aa23.75■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.75■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 YME1L1Q96TA2 773 aa23.75■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.75■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 FAM86B1E9PN63 330 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 REC8O95072 547 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 CYP3A4P08684 503 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 SLC26A2P50443 739 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 PLCB4Q15147 1175 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 PKN1Q16512 942 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 MCTP2Q6DN12 878 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.74■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 STAT5BP51692 787 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 EVCP57679 992 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 HLA-CQ95604 372 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 TRPC6Q9Y210 931 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 SQORQ9Y6N5 450 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 CCNE2O96020 404 aa23.72■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 PSMA5P28066 241 aa23.72■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 KCNQ1P51787 676 aa23.72■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 IGBP1P78318 339 aa23.72■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 NTRK3Q16288 839 aa23.72■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.72■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.72■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 UPP2O95045 317 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF76P36508 570 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 EPC2Q52LR7 807 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 C6orf50Q9HD87 102 aa23.71■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.7■■□□□ 1.39
UBXN4-204ENST00000426921 POTEB3A0JP26 581 aa23.7■■□□□ 1.38
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTS3O15072 1205 aa23.7■■□□□ 1.38
UBXN4-204ENST00000426921 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
UBXN4-204ENST00000426921 IER5Q5VY09 327 aa23.7■■□□□ 1.38
UBXN4-204ENST00000426921 POTEBQ6S5H4 581 aa23.7■■□□□ 1.38
UBXN4-204ENST00000426921 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms