RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425868.5

BBX-208, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 4

Gene BBX, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-208ENST00000425868 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 SEC14L1Q92503 715 aa7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 GPR160Q9UJ42 338 aa7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.33□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PEX14O75381 377 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 RFPL1O75677 317 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 RAC2P15153 192 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 GNALP38405 381 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 SLC6A11P48066 632 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ERVFC1P60507 584 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TUSC3Q13454 348 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TCIRG1Q13488 830 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 LRRC32Q14392 662 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 NR0B2Q15466 257 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 INAVAQ3KP66 663 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 EMC4Q5J8M3 183 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 NXNQ6DKJ4 435 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TTC8Q8TAM2 541 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 INVSQ9Y283 1065 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.32□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PSPNO60542 156 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 LTFP02788 710 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 HPXP02790 462 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 RBP3P10745 1247 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 GDNFP39905 211 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PLCL1Q15111 1095 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 NME9Q86XW9 330 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 CMIPQ8IY22 773 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 CPA6Q8N4T0 437 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 NETO2Q8NC67 525 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 DLG3Q92796 817 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ACAP3Q96P50 834 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ZMAT4Q9H898 229 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 MSRAQ9UJ68 235 aa7.31□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 KLHL33A6NCF5 533 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 FOXP2O15409 715 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 IL33O95760 270 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 EFEMP2O95967 443 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 GLI4P10075 376 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ADCY1Q08828 1119 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 NLRX1Q86UT6 975 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TPH2Q8IWU9 490 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 C7orf31Q8N865 590 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PALD1Q9ULE6 856 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.3□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 LCHNA4D1U4 455 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TADA3O75528 432 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 MYL1P05976 194 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PNLIPP16233 465 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 VCAM1P19320 739 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ITGB7P26010 798 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 FNTBP49356 437 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 EPHA5P54756 1037 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 GRIN1Q05586 938 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 SNX17Q15036 470 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 SEC23AQ15436 765 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 TMEM240Q5SV17 173 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 LILRA2Q8N149 483 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 HIPK4Q8NE63 616 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 MYLIPQ8WY64 445 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 PEX11GQ96HA9 241 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.29□□□□□ -1.24
BBX-208ENST00000425868 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms