RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384179.1

RNU6-458P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 458, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-458P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-458P-201ENST00000384179 PDE6AP16499 860 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SCP2P22307 547 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 LTBRP36941 435 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 COMPP49747 757 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 BLOC1S1P78537 153 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 MPP3Q13368 585 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 LRRC14Q15048 493 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SUSD1Q6UWL2 747 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 DTHD1Q6ZMT9 781 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SERINC5Q86VE9 423 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ANKMY2Q8IV38 441 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 REPS2Q8NFH8 660 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 MYEOVQ96EZ4 313 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 LMLNQ96KR4 655 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 YIPF4Q9BSR8 244 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 AP5M1Q9H0R1 490 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ASH2LQ9UBL3 628 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 TRAK1Q9UPV9 953 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 RWDD3Q9Y3V2 267 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SNED1Q8TER0 1413 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 HIVEP2P31629 2446 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 WNT9AO14904 365 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 WT1P19544 449 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 MPLP40238 635 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 CTSKP43235 329 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 CDK8P49336 464 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 RARRES1P49788 294 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 RABGGTBP53611 331 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 RNF4P78317 190 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ADAM15Q13444 863 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 LLGL1Q15334 1064 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 NPY5RQ15761 445 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ZNF585BQ52M93 769 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 RASIP1Q5U651 963 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 HTR3DQ70Z44 454 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 KRT77Q7Z794 578 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 NEK8Q86SG6 692 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ARHGEF19Q8IW93 802 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SLITRK1Q96PX8 696 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 MTA3Q9BTC8 594 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 FAM117AQ9C073 453 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 NPHS2Q9NP85 383 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SLC7A10Q9NS82 523 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 CHST7Q9NS84 486 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SLC17A6Q9P2U8 582 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 MCM8Q9UJA3 840 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ADAM30Q9UKF2 790 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 POLIQ9UNA4 740 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 MINPP1Q9UNW1 487 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 PIPSLA2A3N6 862 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 PMS2P1A4D2B8 440 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 TMEM200CA6NKL6 621 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 DRGXA6NNA5 263 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L15C9J2P7 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L10C9JJH3 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L13C9JLJ4 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L12C9JPN9 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L11C9JVI0 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L21D6R901 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L18D6R9N7 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L22D6RA61 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L17D6RBQ6 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L19D6RCP7 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP17L20D6RJB6 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 MEIS1O00470 390 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 SGSM2O43147 1006 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 CUTAO60888 179 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 LDLRP01130 860 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 NTRK1P04629 796 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 UMODP07911 640 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 GSTM1P09488 218 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 ABL2P42684 1182 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 USP5P45974 858 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 YARSP54577 528 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 RRADP55042 308 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-458P-201ENST00000384179 CFHR1Q03591 330 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms