RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368632.6

HDAC2-201, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HDAC2, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-201ENST00000368632 GIT2Q14161 759 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 TEKT1Q969V4 418 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 IRAK1P51617 712 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ARHGAP4P98171 946 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 GUCY2DQ02846 1103 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 NFIAQ12857 509 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 SLFN13Q68D06 897 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ZIM3Q96PE6 472 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 NFU1Q9UMS0 254 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 MEIS2O14770 477 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ACTN1P12814 892 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 PRR16Q569H4 304 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 TTMPQ5BVD1 217 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 KRT12Q99456 494 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 DNM3Q9UQ16 869 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 PTK2Q05397 1052 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.131e-16■■□□□ 11.6
HDAC2-201ENST00000368632 DOK7Q18PE1 504 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 SFR1Q86XK3 245 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 IFT81Q8WYA0 676 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 TAF4BQ92750 862 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 SPAG5Q96R06 1193 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 REEP2Q9BRK0 252 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 DNAJC18Q9H819 358 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 MEIS1O00470 390 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 TBX3O15119 743 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 SLC9A1P19634 815 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 RPA1P27694 616 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 PSMC6P62333 389 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 Q4G0T1 1027 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 MKL1Q969V6 931 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ARL8AQ96BM9 186 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 NYAP2Q9P242 653 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ESYT3A0FGR9 886 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CLSTN1O94985 981 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 UCHL3P15374 230 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 TNNC1P63316 161 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 MCTP2Q6DN12 878 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HDAC2-201ENST00000368632 CES2O00748 559 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 CORO7P57737 925 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 GNGT1P63211 74 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 RPS6KA1Q15418 735 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 CFAP58Q5T655 872 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 USP38Q8NB14 1042 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 STK24Q9Y6E0 443 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 SIPA1L1O43166 1804 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 PDXKO00764 312 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 FAM153BP0C7A2 387 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 MYBP10242 640 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 PON1P27169 355 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 HOXD13P35453 343 aa22.07■■□□□ 1.12
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HDAC2-201ENST00000368632 FAM153CQ494X1 144 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 AMNQ9BXJ7 453 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 GRIN2DO15399 1336 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 FAM196BA6NMK8 535 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 MAGEA9P43362 315 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 CRKP46108 304 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC2-201ENST00000368632 SKOR1P84550 965 aa22.07■■□□□ 1.12
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