RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRS2Q9Y4H2 1338 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACOT7O00154 380 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR39O43194 453 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 EYA4O95677 639 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRG1P02750 347 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP17A1P05093 508 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMEP08473 750 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC9A1P19634 815 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDHAP31040 664 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 MC3RP41968 323 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ID4P47928 161 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERVK_113P62684 666 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLG4P78352 724 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDB1Q16531 1140 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 CR1LQ2VPA4 569 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 XP32Q5T750 250 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD276Q5ZPR3 534 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 VASNQ6EMK4 673 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM26EQ8N5C1 309 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC5A5Q92911 643 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGPP1Q9BX95 441 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASSF10A6NK89 507 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALG1L2C9J202 215 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 DVL2O14641 736 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 N4BP3O15049 544 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ULK1O75385 1050 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATF2P15336 505 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 AOAHP28039 575 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 FNTBP49356 437 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 CATSPEREQ5SY80 951 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMC5Q6UXY8 1006 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGDCC3Q8IVU1 814 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZZZ3Q8IYH5 903 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIPK4Q8NE63 616 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB15Q8WXK1 588 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM209Q96SK2 561 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R16BQ96T49 567 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDH18Q9HCL0 1135 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCM1Q9NP62 436 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF839A8K0R7 811 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAX4O43316 350 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGM5O43548 720 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB11FIP3O75154 756 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM253P0C7T8 217 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGS1P23219 599 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLDCP23378 1020 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD40P25942 277 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 MC4RP32245 332 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 LSP1P33241 339 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIMS1P48059 325 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 GUCY2FP51841 1108 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SESN3P58005 492 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHC1P78364 1004 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPHA7Q15375 998 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR158Q5T848 1215 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIPIQ6XZB0 460 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 NME9Q86XW9 330 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 C7orf31Q8N865 590 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 COG1Q8WTW3 980 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNN1Q92952 543 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 E2F7Q96AV8 911 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM84AQ96KN4 292 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIGLEC10Q96LC7 697 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 GBP4Q96PP9 640 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 WRNIP1Q96S55 665 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMAT4Q9H898 229 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC39A2Q9NP94 309 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 HOMER2Q9NSB8 354 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBPJLQ9UBG7 517 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF114Q9Y508 228 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB1Q9Y576 335 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRAK3Q9Y616 596 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms