RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 E9PCH4 1651 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 USP27XA6NNY8 438 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ASNSP08243 561 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 PRPSAP1Q14558 356 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 POLD4Q9HCU8 107 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ADGRB3O60242 1522 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ZBED6P86452 979 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 RPS6KA2Q15349 733 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 CEP152O94986 1710 aa22.81■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 MTMR1Q13613 665 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 PTPREP23469 700 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 AP3B2Q13367 1082 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 CCNYQ8ND76 341 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 NBPF26B4DH59 902 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 NBPF15Q8N660 670 aa22.8■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 MED7O43513 233 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 NDUFA10O95299 355 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 EPHB4P54760 987 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 KCTD6Q8NC69 237 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 PLTPP55058 493 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC63Q05C16 580 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 SCARF1Q14162 830 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ABCB6Q9NP58 842 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 TXNDC9O14530 226 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 MFAP3LO75121 409 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ECE1P42892 770 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB7AO95365 584 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 EFCC1Q9HA90 598 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.79■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 STK36Q9NRP7 1315 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 E9PMD0 336 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ACTN1P12814 892 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 EXOC4Q96A65 974 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 WRNIP1Q96S55 665 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 VCX3BQ9H321 246 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 PRR29P0C7W0 189 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 TERF2Q15554 542 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 FEM1BQ9UK73 627 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 MYL3P08590 195 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 LMNB2Q03252 620 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 K7ERI5 159 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 GSTA1P08263 222 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 GSTA2P09210 222 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 RMDN3Q96TC7 470 aa22.78■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 PRELPP51888 382 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 MYO1EQ12965 1108 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 GRM4Q14833 912 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 CRB1P82279 1406 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 ECEL1O95672 775 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 SFR1Q86XK3 245 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 RAD54LQ92698 747 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 DYDC2Q96IM9 177 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 CALN1Q9BXU9 219 aa22.77■■□□□ 1.24
SMURF1-201ENST00000361125 INHBAP08476 426 aa22.77■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 CASP8Q14790 479 aa22.77■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 UNC13DQ70J99 1090 aa22.77■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 CDKL2Q92772 493 aa22.77■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 FAM81BQ96LP2 452 aa22.77■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.77■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 REREQ9P2R6 1566 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ABCD1P33897 745 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.76■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms