RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341472.9

SYNE2-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE2-201ENST00000341472 RAD9AQ99638 391 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 IGBP1P78318 339 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 TAP1Q03518 808 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.92■■□□□ 1.26
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SYNE2-201ENST00000341472 PPM1EQ8WY54 764 aa22.92■■□□□ 1.26
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SYNE2-201ENST00000341472 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.92■■□□□ 1.26
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SYNE2-201ENST00000341472 DEXIO95424 95 aa22.9■■□□□ 1.26
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SYNE2-201ENST00000341472 CHRNA1P02708 482 aa22.9■■□□□ 1.26
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SYNE2-201ENST00000341472 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.9■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.9■■□□□ 1.26
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SYNE2-201ENST00000341472 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.9■■□□□ 1.26
SYNE2-201ENST00000341472 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.89■■□□□ 1.25
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SYNE2-201ENST00000341472 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.89■■□□□ 1.25
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SYNE2-201ENST00000341472 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 POTEBQ6S5H4 581 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 USP38Q8NB14 1042 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 TET1Q8NFU7 2136 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.89■■□□□ 1.25
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SYNE2-201ENST00000341472 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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SYNE2-201ENST00000341472 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.87■■□□□ 1.25
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SYNE2-201ENST00000341472 ZNF302Q9NR11 478 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 INSL6Q9Y581 213 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.87■■□□□ 1.25
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SYNE2-201ENST00000341472 GHRP10912 638 aa22.86■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 MGAT3Q09327 533 aa22.86■■□□□ 1.25
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SYNE2-201ENST00000341472 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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SYNE2-201ENST00000341472 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.85■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.85■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.85■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.85■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 EPOPA6NHQ4 379 aa22.84■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 PFKFB2O60825 505 aa22.84■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 KLRC1P26715 233 aa22.84■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 SCRN1Q12765 414 aa22.84■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 LPIN1Q14693 890 aa22.84■■□□□ 1.25
SYNE2-201ENST00000341472 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.84■■□□□ 1.25
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