RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 AZI2Q9H6S1 392 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPC6Q9Y210 931 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP4R4-202ENST00000328839 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
PPP4R4-202ENST00000328839 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP4R4-202ENST00000328839 NEK1Q96PY6 1258 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP4R4-202ENST00000328839 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP4R4-202ENST00000328839 SDF4Q9BRK5 362 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.64■■■□□ 2.18
PPP4R4-202ENST00000328839 INSRRP14616 1297 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 RTN1Q16799 776 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TCEAL5Q5H9L2 206 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.63■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 RRN3P2A6NIE6 340 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 ADCY7P51828 1080 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 SKAP1Q86WV1 359 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 PCYT2Q99447 389 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC3P53804 2025 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 H3BQ06 376 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 M0QZ92 97 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 ENPP3O14638 875 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBTB43O43298 467 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 IL9P15248 144 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 ANO3Q9BYT9 981 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 CD320Q9NPF0 282 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 CD52P31358 61 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 ACTR2P61160 394 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM31Q5JXX7 168 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 IER5Q5VY09 327 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 LRFN3Q9BTN0 628 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 RWDD3Q9Y3V2 267 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 GOLGA8AA7E2F4 631 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 CSPG5O95196 566 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 ARP10275 920 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM178BQ8IXR5 827 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 NFASCO94856 1347 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 MYO7AQ13402 2215 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1671Q9BY89 1806 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 SMCO2A6NFE2 343 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 STXBP3O00186 592 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF76P36508 570 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 BMPR1AP36894 532 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 STAT5BP51692 787 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 PLCB4Q15147 1175 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 CEP55Q53EZ4 464 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 GJD3Q8N144 294 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM260Q9NX78 707 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 CLDND1Q9NY35 253 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPV2Q9Y5S1 764 aa28.58■■■□□ 2.17
PPP4R4-202ENST00000328839 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM86C2PA6NEL3 165 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 RB1P06400 928 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 NEK9Q8TD19 979 aa28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 GRXCR2A6NFK2 248 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 C5orf67F2Z3F1 127 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 FUT2Q10981 343 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM122AQ96E09 287 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 POTEB3A0JP26 581 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 GRM6O15303 877 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 FGD1P98174 961 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 PAK2Q13177 524 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 AP3B2Q13367 1082 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 POTEBQ6S5H4 581 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms