RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 GANQ9H2C0 597 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP83Q9Y592 693 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMP14P50281 582 aa24.39■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.39■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT71Q3SY84 523 aa24.39■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.39■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC9A1P19634 815 aa24.39■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSMD2Q13200 908 aa24.39■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.39■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.39■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TATDN2Q93075 761 aa24.39■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.499e-10■■■■■ 79.8
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 SGSM3Q96HU1 749 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 NF2P35240 595 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRIK5Q16478 980 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PBKQ96KB5 322 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.493e-7■■■□□ 16.8
GRAMD1A-201ENST00000317991 C21orf2O43822 256 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNH2Q12809 1159 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC51AQ86UW1 340 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM212AQ96EL1 285 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 C5orf60A6NFR6 353 aa24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPS15P42566 896 aa24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMIM5Q71RC9 77 aa24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 F8W031 263 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 EP400NLQ6ZTU2 488 aa24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPAINQ86UA6 219 aa24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 NR2E1Q9Y466 385 aa24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 E9PMD0 336 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAM9Q13443 819 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGBL2Q5U5Z8 902 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 HVCN1Q96D96 273 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAGPAQ9UK23 515 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L5A8MUK1 530 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CES2O00748 559 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 DRD4P21917 467 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCT6BQ92526 530 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 F8VZ95 297 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 C3orf20Q8ND61 904 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNNI2P48788 182 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDIA5Q14554 519 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PEX26Q7Z412 305 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIRREL3Q8IZU9 778 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPAG5Q96R06 1193 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNMA2Q9UL42 364 aa24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TOM1O60784 492 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAEPP09466 180 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 COPB2P35606 906 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP63Q96MT8 703 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 EYA3Q99504 573 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAND2O75155 1236 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSMD1Q99460 953 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAB34Q9BZG1 259 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 SIK1P57059 783 aa24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFFO1Q0D2I5 559 aa24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTMR3Q13615 1198 aa24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBE2SQ16763 222 aa24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 VEZTQ9HBM0 779 aa24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.33■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHBGP04278 402 aa24.33■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 UCHL3P15374 230 aa24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms