RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 ATP9AO75110 1047 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TPM2P07951 284 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 CNGA4Q8IV77 575 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 ACAD9Q9H845 621 aa25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 SFI1A8K8P3 1242 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TPM1P09493 284 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 OTUD5Q96G74 571 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TRAF5O00463 557 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 IRF6O14896 467 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 NR3C2P08235 984 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM14Q14142 442 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 SAMM50Q9Y512 469 aa25.21■■□□□ 1.63
VSTM4-201ENST00000298454 MYBP10242 640 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ERCC3P19447 782 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 KIF20AO95235 890 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 CCND2P30279 289 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 KLK7P49862 253 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 TERF1P54274 439 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 MTF1Q14872 753 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 NEK9Q8TD19 979 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.2■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 HOXD13P35453 343 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 PPATQ06203 517 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 SYCP1Q15431 976 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 VWA3BQ502W6 1294 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC51Q96ER9 411 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 TTC26A0AVF1 554 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 NF2P35240 595 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 KRT9P35527 623 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF592Q92610 1267 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRFP10586 1907 aa25.18■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 FAM13AO94988 1023 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 MAN2A1Q16706 1144 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 LBX2Q6XYB7 198 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ERO1BQ86YB8 467 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 NDST4Q9H3R1 872 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 BTBD7Q9P203 1132 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 RASSF10A6NK89 507 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 GPR162Q16538 588 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.16■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 GLTPD2A6NH11 291 aa25.16■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 GCNT3O95395 438 aa25.16■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 CCNE2O96020 404 aa25.16■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.16■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 MYCT1Q8N699 235 aa25.16■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 DESI2Q9BSY9 194 aa25.16■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.16■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 CCP110O43303 1012 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 RGS20O76081 388 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 GAP43P17677 238 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 FECHP22830 423 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 CEP63Q96MT8 703 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 UQCRHP07919 91 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 GPRASP2Q96D09 838 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 PARVGQ9HBI0 331 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.15■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN12O43309 604 aa25.14■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 ERVK-24P63145 666 aa25.14■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 KCNA1Q09470 495 aa25.14■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 UGCGQ16739 394 aa25.14■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.14■■□□□ 1.62
VSTM4-201ENST00000298454 NLRX1Q86UT6 975 aa25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms