RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 LRIG3Q6UXM1 1119 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 RAPGEF5Q92565 580 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PCMTD2Q9NV79 361 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PHF24Q9UPV7 400 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 EVI5O60447 810 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PPP4CP60510 307 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 CPLX4Q7Z7G2 160 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 ZWILCHQ9H900 591 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 GDF3Q9NR23 364 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 DEXIO95424 95 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 MMP1P03956 469 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 CMPK2Q5EBM0 449 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PIM2Q9P1W9 311 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 SCNN1BP51168 640 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 GSTO1P78417 241 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 ANO7Q6IWH7 933 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K14Q99558 947 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 NQO1P15559 274 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 WASF1Q92558 559 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 MYH6P13533 1939 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PKN1Q16512 942 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 ERICH1Q86X53 443 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 RMI1Q9H9A7 625 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 BAG3O95817 575 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 BTDP43251 543 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 ADAM9Q13443 819 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 ITIH4Q14624 930 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 C8orf74Q6P047 294 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 TMEM165Q9HC07 324 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.427e-6■■■■■ 74.5
PITX1-201ENST00000265340 SWAP70Q9UH65 585 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 TSPY2A6NKD2 308 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 F8W031 263 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 NR5A1Q13285 461 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 BIRC3Q13489 604 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 OXER1Q8TDS5 423 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 WHAMMQ8TF30 809 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K13O43283 966 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 FAM153BP0C7A2 387 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 FAM153CQ494X1 144 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 SPATA20Q8TB22 786 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 FAM153AQ9UHL3 310 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 UPP2O95045 317 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 LDHCP07864 332 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 MYZAPP0CAP1 466 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 LRRC42Q9Y546 428 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 CDC25AP30304 524 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R2AP63151 447 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 DOK7Q18PE1 504 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 NFU1Q9UMS0 254 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PLAAQ9Y263 795 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 BCS1LQ9Y276 419 aa23.9■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V1G1O75348 118 aa23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PSMC4P43686 418 aa23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 TFAP4Q01664 338 aa23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 CUL4BQ13620 913 aa23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R5BQ15173 497 aa23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.89■■□□□ 1.42
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms