RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 OTOFQ9HC10 1997 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 A0A1W2PQC6 194 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TTC26A0AVF1 554 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 BCRP11274 1271 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 DNM2P50570 870 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 RIT2Q99578 217 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TSG101Q99816 390 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 LXNQ9BS40 222 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.63■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 SFI1A8K8P3 1242 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PEX10O60683 326 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TPM1P09493 284 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 FDX1P10109 184 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 MTMR1Q13613 665 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 SULF1Q8IWU6 871 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 JADE2Q9NQC1 790 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 RASSF10A6NK89 507 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TRAF5O00463 557 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 MYBP10242 640 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 KRT9P35527 623 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 EPHA7Q15375 998 aa20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 MAP3K9P80192 1104 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TREML2Q5T2D2 321 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PTPRFP10586 1907 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 HOXD13P35453 343 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 ERVK-24P63145 666 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM14Q14142 442 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PLS1Q14651 629 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.61■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.6■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 ATP9AO75110 1047 aa20.6■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 VWA3BQ502W6 1294 aa20.6■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 MOB2Q70IA6 237 aa20.6■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.6■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC51Q96ER9 411 aa20.6■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 A0A0U1RQJ8 604 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 NDST4Q9H3R1 872 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PNMA2Q9UL42 364 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 FECHP22830 423 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 OAZ1P54368 228 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 DMTNQ08495 405 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 NACC1Q96RE7 527 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 ZSCAN12O43309 604 aa20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 KCNA1Q09470 495 aa20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 MAN2A1Q16706 1144 aa20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 SAMM50Q9Y512 469 aa20.58■□□□□ 0.89
SIKE1-201ENST00000060969 FANCGO15287 622 aa20.58■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.58■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CHP1Q99653 195 aa20.58■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ELP3Q9H9T3 547 aa20.58■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.58■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.58■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 CSADQ9Y600 493 aa20.58■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SIKE1-201ENST00000060969 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms