RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 TMEM169Q96HH4 297 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 VPS11Q9H270 941 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 TMEM60Q9H2L4 133 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 GPR27Q9NS67 375 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 OXSMQ9NWU1 459 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 RTEL1Q9NZ71 1219 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 KCNG1Q9UIX4 513 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 TPCN1Q9ULQ1 816 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 FHOD1Q9Y613 1164 aa3□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 PRSS47A8MTI9 375 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 FAM227AF5H4B4 570 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 H3BML4 177 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 H7C1D1 291 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 K7ENM7 598 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 TGM5O43548 720 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 MGEA5O60502 916 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 AOC2O75106 756 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 HIP1RO75146 1068 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 VAMP4O75379 141 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 CST3P01034 146 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 CAP2P40123 477 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 RXRGP48443 463 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 DNM2P50570 870 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 IRAK1P51617 712 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 TERF1P54274 439 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 POU4F1Q01851 419 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 ID3Q02535 119 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 TNFAIP2Q03169 654 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 ZNF174Q15697 407 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 DPY19L1Q2PZI1 675 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 NBPF9Q3BBW0 867 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 TUBB8Q3ZCM7 444 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 CCDC38Q502W7 563 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 RNF220Q5VTB9 566 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 FAAH2Q6GMR7 532 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 DENND5AQ6IQ26 1287 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 LILRA6Q6PI73 481 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 C16orf59Q7L2K0 433 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 OTOP3Q7RTS5 596 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 OVCH1Q7RTY7 1134 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 KRT77Q7Z794 578 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 DENND1CQ8IV53 801 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 PPIL6Q8IXY8 311 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 KRT78Q8N1N4 520 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 FIBCD1Q8N539 461 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 OR2C3Q8N628 320 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 KREMEN2Q8NCW0 462 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 RNF214Q8ND24 703 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 JADE3Q92613 823 aa2.99□□□□□ -1.93
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ATRX-220ENST00000635865 RIPOR3Q96MK2 946 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 ZDHHC15Q96MV8 337 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 TTC14Q96N46 770 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 NACC1Q96RE7 527 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 MDFIQ99750 246 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 NRSN2Q9GZP1 204 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 UNC45AQ9H3U1 944 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 RSAD1Q9HA92 442 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 PDLIM7Q9NR12 457 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 DISC1Q9NRI5 854 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 RASSF1Q9NS23 344 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 TOMM22Q9NS69 142 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 SLC6A14Q9UN76 642 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 L1RE1Q9UN81 338 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 CEP131Q9UPN4 1083 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa2.99□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 A0A1B0GVC2 190 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 CCDC66A2RUB6 948 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 FAM229AH3BQW9 127 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 LINC01387J3KSC0 135 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 FSCN2O14926 492 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 SHOXO15266 292 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 MAFKO60675 156 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 UBXN7O94888 489 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 MBD4O95243 580 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 PYGLP06737 847 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 PDCP20941 246 aa2.98□□□□□ -1.93
ATRX-220ENST00000635865 RRM1P23921 792 aa2.98□□□□□ -1.93
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