RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OAZ3Q9UMX2 235 aa3.1□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WASF3Q9UPY6 502 aa3.1□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CDC14BO60729 498 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ITGAVP06756 1048 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C1SP09871 688 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ACRV1P26436 265 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CASP7P55210 303 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FANCCQ00597 558 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HHEXQ03014 270 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF654Q8IZM8 581 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 STPG3Q8N7X2 389 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KATNBL1Q9H079 304 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FBXL7Q9UJT9 491 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa3.09□□□□□ -1.91
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC27A2O14975 620 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CUTAO60888 179 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RAMP2O60895 175 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SCG5P05408 212 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RPS19P39019 145 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TESK1Q15569 626 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SV2CQ496J9 727 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PROSER1Q86XN7 944 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GPRASP2Q96D09 838 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SCYL1Q96KG9 808 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LGR4Q9BXB1 951 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KCND1Q9NSA2 647 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NR2E1Q9Y466 385 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.08□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LCP1P13796 627 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAHP16930 419 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 POLD1P28340 1107 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RACK1P63244 317 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PFKPQ01813 784 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CYP4F3Q08477 520 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TUSC3Q13454 348 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRSS53Q2L4Q9 553 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 Q6ZSN1 163 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF227Q86WZ6 799 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KREMEN2Q8NCW0 462 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IL17DQ8TAD2 202 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRRX2Q99811 253 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BACH2Q9BYV9 841 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MSL2Q9HCI7 577 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.07□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ESYT3A0FGR9 886 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARNTLO00327 626 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PLSCR1O15162 318 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CYP27B1O15528 508 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RRADP55042 308 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SPIRE1Q08AE8 756 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RNF151Q2KHN1 245 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LDLRAD1Q5T700 205 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CD276Q5ZPR3 534 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RASGRP4Q8TDF6 673 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CLEC4DQ8WXI8 215 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 VOPP1Q96AW1 172 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SHDQ96IW2 340 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 JAM3Q9BX67 310 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PLA2G12BQ9BX93 195 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TLR9Q9NR96 1032 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.06□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM191CA6NGB0 347 aa3.05□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF839A8K0R7 811 aa3.05□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARHGAP6O43182 974 aa3.05□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TBX1O43435 398 aa3.05□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GNAT1P11488 350 aa3.05□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GFRA1P56159 465 aa3.05□□□□□ -1.92
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WDR72Q3MJ13 1102 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms