RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMM50Q9Y512 469 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 NFASCO94856 1347 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CHMP2AO43633 222 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MED24O75448 989 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PAK1Q13153 545 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 IL31RAQ8NI17 732 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MTRQ99707 1265 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 BTBD19C9JJ37 291 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SPAG1Q07617 926 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR78Q5VTH9 848 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA1Q5VX52 437 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 GPBP1Q86WP2 473 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TPH2Q8IWU9 490 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 GJA10Q969M2 543 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 STRNO43815 780 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CNMDO75829 334 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 IDEP14735 1019 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC25BP30305 580 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 DRC7Q8IY82 874 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX12PQ92771 950 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-212ENST00000591041 POTEFA5A3E0 1075 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MYMKA6NI61 221 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ASB14A6NK59 587 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ICAM3P32942 547 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 POTEGQ6S5H5 508 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC102AQ96A19 550 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 DYDC2Q96IM9 177 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RASSF10A6NK89 507 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 E9PMD0 336 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SERPINC1P01008 464 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 TGFB3P10600 412 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 GAP43P17677 238 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 BMP6P22004 513 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CASP1P29466 404 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP4A11Q02928 519 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RGMBQ6NW40 437 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 TIPINQ9BVW5 301 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PANK4Q9NVE7 773 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WWV3 80 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 KLRC4O43908 158 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PSAPP07602 524 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 TPM2P07951 284 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF75DP51815 510 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SREBF2Q12772 1141 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 UIMC1Q96RL1 719 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 TSG101Q99816 390 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 EML1O00423 815 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SLITRK3O94933 977 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 LYPLA2O95372 231 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPK4P31152 587 aa25.17■■□□□ 1.62
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