RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RESP18Q5W5W9 173 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MCUQ8NE86 351 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 CLRN2A0PK11 232 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L8P0C7I0 530 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 BASP1P80723 227 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC24Q6P3W2 148 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 S100BP04271 92 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 BIRC2Q13490 618 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MT-ND3P03897 115 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 KCTD6Q8NC69 237 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 NEK9Q8TD19 979 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SASH1O94885 1247 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SKIP12755 728 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 AKT3Q9Y243 479 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 RASGRF2O14827 1237 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ARID5BQ14865 1188 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 CEP170P1Q96L14 293 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 CCNYQ8ND76 341 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8CPA6NN73 597 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 TXLNGQ9NUQ3 528 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 BCS1LQ9Y276 419 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 STX1BP61266 288 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 PARVGQ9HBI0 331 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SLC24A3Q9HC58 644 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 APOEP02649 317 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 IL1RL1Q01638 556 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP36Q96G28 342 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 FMO2Q99518 471 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 LIFRP42702 1097 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 BMP3P12645 472 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 DDIT3P35638 169 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ESRRGP62508 458 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L3A6NCW0 530 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L4A6NCW7 530 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC63Q05C16 580 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 NFU1Q9UMS0 254 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 CCND2P30279 289 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MED7O43513 233 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K7O43318 606 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 TOM1L1O75674 476 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 PLS3P13797 630 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP10Q86W26 655 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 INPP1P49441 399 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 STAT2P52630 851 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB33Q86T24 672 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SAAL1Q96ER3 474 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 METP08581 1390 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 CALN1Q9BXU9 219 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SNX25Q9H3E2 840 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-211ENST00000580170 XPOTO43592 962 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 MXI1P50539 228 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CUL1Q13616 776 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 SARM1Q6SZW1 724 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 DNAAF3Q8N9W5 541 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 CNKSR1Q969H4 720 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-211ENST00000580170 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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