RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.6■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.58■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.58■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF536O15090 1300 aa23.56■■□□□ 1.36
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCND2Q9NZV8 630 aa23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHMP2AO43633 222 aa23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBXN2AP68543 259 aa23.55■■□□□ 1.36
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