RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC102BQ68D86 513 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 ARMT1Q9H993 441 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-210ENST00000551525 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRB-210ENST00000551525 MCF2LO15068 1137 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 TTLL1O95922 423 aa6.84□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 GTF2A2P52657 109 aa6.84□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 TSC22D1Q15714 1073 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 STK32CQ86UX6 486 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 FAM167AQ96KS9 214 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 AMNQ9BXJ7 453 aa6.84□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 KLC4Q9NSK0 619 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ABCC12Q96J65 1359 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 MAN1A2O60476 641 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 BAG2O95816 211 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 CCT5P48643 541 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 CDC42EP1Q00587 391 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB16Q05516 673 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 JAG2Q9Y219 1238 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.83□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 USP17L15C9J2P7 530 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L11C9JVI0 530 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L18D6R9N7 530 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L22D6RA61 530 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L19D6RCP7 530 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L20D6RJB6 530 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PSMA7O14818 248 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CTAGE8P0CG41 777 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SKIP12755 728 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CRKP46108 304 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L24Q0WX57 530 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SCRN1Q12765 414 aa6.82□□□□□ -1.32
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