RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF146Q9NTX7 359 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 MYPNQ86TC9 1320 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PQC6 194 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP2A1O14983 1001 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF76P36508 570 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 MB21D1Q8N884 522 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 IL31RAQ8NI17 732 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP7D2Q96T17 732 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.53■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SOCS7O14512 581 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 IDEP14735 1019 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 SYCP1Q15431 976 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPPQ6IPU0 288 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 HPS3Q969F9 1004 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PNMA2Q9UL42 364 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 LCTP09848 1927 aa22.52■■□□□ 1.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 STAT3P40763 770 aa22.52■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.52■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.52■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.52■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.52■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.52■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC175P0C221 793 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 FECHP22830 423 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 DNM2P50570 870 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM20AQ96MK3 541 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 STK24Q9Y6E0 443 aa22.51■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 ERMNQ8TAM6 284 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAI1Q9UI46 699 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 EHHADHQ08426 723 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP55Q53EZ4 464 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 NSMFQ6X4W1 530 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 LBX2Q6XYB7 198 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 BTBD7Q9P203 1132 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 VAV3Q9UKW4 847 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 MEIS1O00470 390 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G4BP0C869 781 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 ARP10275 920 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 PLS1Q14651 629 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 MTF1Q14872 753 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 DESI2Q9BSY9 194 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEB3A0JP26 581 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 E9PMD0 336 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT9P35527 623 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC63Q05C16 580 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEBQ6S5H4 581 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 PANK4Q9NVE7 773 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 B4DLN1 442 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGB5P18084 799 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 COASYQ13057 564 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 MED24O75448 989 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC5A5Q92911 643 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMD10O75832 226 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.46■■□□□ 1.19
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