RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	UBXN4	Q92575	508 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753		H7BY64	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	FZD7	O75084	574 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	EPHB4	P54760	987 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	LSAMP	Q13449	338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	CYR61	O00622	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	GRIN1	Q05586	938 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HERC4-215	ENST00000515753	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	MUSK	O15146	869 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF623	O75123	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CYP7B1	O75881	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	DGKI	O75912	1065 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	KLF10	Q13118	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	NTRK3	Q16288	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753		Q8TCH9	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SLC27A2	O14975	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PRODH	O43272	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	COL6A1	P12109	1028 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SELENOP	P49908	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	USP51	Q70EK9	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	MSC	O60682	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	KLHL18	O94889	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	CKM	P06732	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	GLRB	P48167	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	GPR85	P60893	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HERC4-215	ENST00000515753	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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