RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-208ENST00000468570 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 CR2P20023 1033 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 RAC3P60763 192 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 FOXL1Q12952 345 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 DUSP8Q13202 625 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 POLNQ7Z5Q5 900 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 BVESQ8NE79 360 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 TMEM176AQ96HP8 235 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 WRNIP1Q96S55 665 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 KCND1Q9NSA2 647 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 CEP72Q9P209 647 aa3.61□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 USP10Q14694 798 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 VHLLQ6RSH7 139 aa3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 TRIM59Q8IWR1 403 aa3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 TELO2Q9Y4R8 837 aa3.6□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 ESYT3A0FGR9 886 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 MYO1BO43795 1136 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 MAKP20794 623 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 ADRA1BP35368 520 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 PFKPQ01813 784 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 ZNF568Q3ZCX4 644 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 EMC4Q5J8M3 183 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 LDLRAD1Q5T700 205 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 DENND5AQ6IQ26 1287 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 PPIL6Q8IXY8 311 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 TMEM87AQ8NBN3 555 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 KATNBL1Q9H079 304 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-208ENST00000468570 SLC39A2Q9NP94 309 aa3.59□□□□□ -1.83
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SGIP1-208ENST00000468570 ZBTB7CA1YPR0 619 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 ANKRD34BA5PLL1 514 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 MSCO60682 206 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 COL6A2P12110 1019 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 ADCY8P40145 1251 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 KCNJ6P48051 423 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 RACK1P63244 317 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 CHRNA2Q15822 529 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 CD276Q5ZPR3 534 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 KREMEN2Q8NCW0 462 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 CRBNQ96SW2 442 aa3.58□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 CYP26B1Q9NR63 512 aa3.58□□□□□ -1.84
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SGIP1-208ENST00000468570 SLC25A3Q00325 362 aa3.57□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 LSAMPQ13449 338 aa3.57□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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SGIP1-208ENST00000468570 FAM89AQ96GI7 184 aa3.57□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.57□□□□□ -1.84
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SGIP1-208ENST00000468570 TUSC3Q13454 348 aa3.56□□□□□ -1.84
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SGIP1-208ENST00000468570 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.56□□□□□ -1.84
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SGIP1-208ENST00000468570 SMOC1Q9H4F8 434 aa3.56□□□□□ -1.84
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SGIP1-208ENST00000468570 H7BY64 318 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 ITGAVP06756 1048 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 FAHP16930 419 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 STAT3P40763 770 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 GIPRP48546 466 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 KCNQ1P51787 676 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 GTF2A2P52657 109 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 PAK2Q13177 524 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-208ENST00000468570 KCNAB2Q13303 367 aa3.55□□□□□ -1.84
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