RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 PLPP6Q8IY26 295 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MB21D1Q8N884 522 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FIZ1Q96SL8 496 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQJ5 194 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 TRIM47Q96LD4 638 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 ATP2A1O14983 1001 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 N4BP3O15049 544 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 CASP5P51878 434 aa6.28□□□□□ -1.4
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