RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.65■■□□□ 1.38
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FEZ1Q99689 392 aa23.65■■□□□ 1.38
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR59Q6PJI9 974 aa23.65■■□□□ 1.38
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.65■■□□□ 1.38
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.64■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LDHDQ86WU2 507 aa23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GLIS3Q8NEA6 775 aa23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LPAR1Q92633 364 aa23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC5A5Q92911 643 aa23.64■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.64■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.64■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.63■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLK7P49862 253 aa23.63■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.63■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR18Q9BV38 432 aa23.63■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.63■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.63■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MEIS1O00470 390 aa23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MARSP56192 900 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMC6P62333 389 aa23.62■■□□□ 1.37
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CEP55Q53EZ4 464 aa23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCTD10Q9H3F6 313 aa23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMD10O75832 226 aa23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D5Q92609 795 aa23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 REEP2Q9BRK0 252 aa23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.61■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GAS7O60861 476 aa23.6■■□□□ 1.37
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