RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551901.5

RRN3P1-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RRN3P1, Length 1,157 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-204ENST00000551901 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 NBR1Q14596 966 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM240Q5SV17 173 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 RASIP1Q5U651 963 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 NLRX1Q86UT6 975 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM199Q8N511 208 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 ANO3Q9BYT9 981 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 JADE2Q9NQC1 790 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 TMEM260Q9NX78 707 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 SORBS3O60504 671 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF286BP0CG31 522 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 SREBF1P36956 1147 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 AP3B2Q13367 1082 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 HIC1Q14526 733 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 CDHR1Q96JP9 859 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 PGBD1Q96JS3 809 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 GPR20Q99678 358 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 IL23AQ9NPF7 189 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.91□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 MEIS1O00470 390 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 EDIL3O43854 480 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 PPFIA3O75145 1194 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 LGALS2P05162 132 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 CYP3A4P08684 503 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 HOXC8P31273 242 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 NUBP1P53384 320 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 RBL2Q08999 1139 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 SCN5AQ14524 2016 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 MFSD10Q14728 455 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 PTGISQ16647 500 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF365Q70YC5 407 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 TPCN1Q9ULQ1 816 aa11.9□□□□□ -0.5
RRN3P1-204ENST00000551901 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 H3BRB1 525 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 PITPNM1O00562 1244 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 PFKFB2O60825 505 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 IQCF3P0C7M6 154 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 ARP10275 920 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 ACRP10323 421 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 GNA11P29992 359 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 CCL23P55773 120 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 SCRN1Q12765 414 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 MTMR1Q13613 665 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 GPNMBQ14956 572 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 CEP55Q53EZ4 464 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 MCTP2Q6DN12 878 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 C7orf31Q8N865 590 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 SCLYQ96I15 445 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 ALG1Q9BT22 464 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 C6orf50Q9HD87 102 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 TANC1Q9C0D5 1861 aa11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM86B1E9PN63 330 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 AK2P54819 239 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 ADAM17P78536 824 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 ARHGAP4P98171 946 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 STK3Q13188 491 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 C8orf34Q49A92 452 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 TET1Q8NFU7 2136 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 CAGE1Q8TC20 777 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 HERVK_113Q902F9 699 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1-204ENST00000551901 VPS54Q9P1Q0 977 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms