RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 EDNRBP24530 442 aa22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 LIFRP42702 1097 aa22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZP2Q05996 745 aa22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMTC2Q8N394 836 aa22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.25■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.24■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.24■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 CFBP00751 764 aa22.24■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 COPS5Q92905 334 aa22.24■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP3K14Q99558 947 aa22.24■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.24■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIP14410 1827 aa22.24■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 NCK2O43639 380 aa22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSPA4P34932 840 aa22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 BANK1Q8NDB2 785 aa22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.23■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 AMHP03971 560 aa22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF5BP33176 963 aa22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT32Q14532 448 aa22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL19A1Q14993 1142 aa22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 MICU3Q86XE3 530 aa22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNB2Q92953 911 aa22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.22■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 ST18O60284 1047 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 REC8O95072 547 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTK7Q13308 1070 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 EPC2Q52LR7 807 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 C7orf31Q8N865 590 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 AFG1LQ8WV93 481 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRRX2Q99811 253 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 EMSYQ7Z589 1322 aa22.21■■□□□ 1.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 H3BNC9 293 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 GH1P01241 217 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 MMP3P08254 477 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 CALM1P0DP23 149 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 CALM2P0DP24 149 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 CALM3P0DP25 149 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSD17B4P51659 736 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 FANCBQ8NB91 859 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 RMDN3Q96TC7 470 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.2■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 LGR5O75473 907 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 IRS1P35568 1242 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 PKN1Q16512 942 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 DGKDQ16760 1214 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCTN1Q2MV58 587 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 APOA5Q6Q788 366 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 KAT2BQ92831 832 aa22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARIH2O95376 493 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 GNAQP50148 359 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPN5P54829 565 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPM6BQ13491 265 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAF1Q9H063 256 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.18■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMARCA1P28370 1054 aa22.17■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.17■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms