RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522307.5

TMPRSS4-211, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMPRSS4, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-211ENST00000522307 UQCRHLA0A096LP55 91 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 UQCRHP07919 91 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 POLR2MP0CAP2 368 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 RAG1P15918 1043 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 ARHGAP1Q07960 439 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 ITGA7Q13683 1181 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TTLL4Q14679 1199 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 STXBP2Q15833 593 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 Q9Y3F1 56 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 KAT6AQ92794 2004 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 MYO9BQ13459 2157 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CHMP4BP1P59074 171 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TRAF1Q13077 416 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 SHHQ15465 462 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 AFG1LQ8WV93 481 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TOX2Q96NM4 488 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 IWS1Q96ST2 819 aa15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 PTPRSQ13332 1948 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 WDR81Q562E7 1941 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 B4DLN1 442 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 B4GALT4O60513 344 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 DTNBO60941 627 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CPT1AP50416 773 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 KRT85P78386 507 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 NTRK3Q16288 839 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 UBE2SQ16763 222 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 WASF1Q92558 559 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 ZEB2O60315 1214 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 JAK2O60674 1132 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 DEXIO95424 95 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CD4P01730 458 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 MMP3P08254 477 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 Q7L0L9 218 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 GDPD2Q9HCC8 539 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 SYCE3A1L190 88 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 A6NJR5 290 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 MEIS2O14770 477 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 SCG2P13521 617 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 XBP1P17861 261 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CYP2C18P33260 490 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 FUT2Q10981 343 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 MAF1Q9H063 256 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CABYRO75952 493 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CTDNEP1O95476 244 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 GH1P01241 217 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 ZNF286BP0CG31 522 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CCND2P30279 289 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 SP2Q02086 613 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 FPGSQ05932 587 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TRIM29Q14134 588 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 STK36Q9NRP7 1315 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 FIBPO43427 364 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 TIMP1P01033 207 aa15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4-211ENST00000522307 CYP2C9P11712 490 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms