RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NLRP5P59047 1200 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DAB2P98082 770 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NELFBQ8WX92 580 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GSDMAQ96QA5 445 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDE11AQ9HCR9 933 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCB6Q9NP58 842 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDC23Q9UJX2 597 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM205AQ6ZU69 1335 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ENC1O14682 589 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIF5CO60282 957 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIM37O94972 964 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 XBP1P17861 261 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRC15Q8TF66 581 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABHD10Q9NUJ1 306 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RREB1Q92766 1687 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAF1P21675 1872 aa7.38□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNJ18B7U540 433 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRGAP2O75044 1071 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRT9P35527 623 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PHKA2P46019 1235 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VSNL1P62760 191 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBXN1Q04323 297 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNJ12Q14500 433 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C4orf17Q53FE4 359 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FERMT2Q96AC1 680 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LY75O60449 1722 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RTL9Q8NET4 1388 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC66A2RUB6 948 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CTAGE9A4FU28 777 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAPN2P17655 700 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KLK7P49862 253 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MECOMQ03112 1051 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IQCA1Q86XH1 822 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IQUBQ8NA54 791 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CPVLQ9H3G5 476 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BCORQ6W2J9 1755 aa7.37□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DOCK2Q92608 1830 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTC26A0AVF1 554 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAP2K7O14733 419 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP8B1O43520 1251 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PHACTR2O75167 634 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCG2P13521 617 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRDX5P30044 214 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAK1Q13153 545 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 USP20Q9Y2K6 914 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYH6P13533 1939 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYH8P13535 1937 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRP5O75197 1615 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LMAN1P49257 510 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RCAN1P53805 252 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GNASQ5JWF2 1037 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.36□□□□□ -1.23
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.5 ms