RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487625.1

USP9X-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, human

TSL 2

Gene USP9X, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP9X-208	ENST00000487625	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	FPR2	P25090	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	FOXL1	Q12952	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	MATN2	O00339	956 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	GREM1	O60565	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	CDC14B	O60729	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	PWP1	Q13610	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	GPR162	Q16538	588 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	SCRN1	Q12765	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP9X-208	ENST00000487625	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	CHGB	P05060	677 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	MAPK7	Q13164	816 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625		Q8N1Y9	231 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	MMP19	Q99542	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	INF2	Q27J81	1249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	WASF1	Q92558	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625		X6R8D5	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	IKBKB	O14920	756 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	PLS3	P13797	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	WHRN	Q9P202	907 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	AMPD2	Q01433	879 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	TADA3	O75528	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	MCM4	P33991	863 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP9X-208	ENST00000487625	FBXO21	O94952	628 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF165	P49910	485 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	CFHR4	Q92496	578 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	GRB10	Q13322	594 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.51	□□□□□ -1.69
USP9X-208	ENST00000487625	CEP68	Q76N32	757 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms