RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487251.5

LRRC1-203, Transcript of leucine rich repeat containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRRC1, Length 2,527 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1-203ENST00000487251 CCDC175P0C221 793 aa25.2■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 FECHP22830 423 aa25.2■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 GNG11P61952 73 aa25.2■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 CCDC51Q96ER9 411 aa25.2■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TEPSINQ96N21 525 aa25.2■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 VAV3Q9UKW4 847 aa25.2■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 EML1O00423 815 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 DNM2P50570 870 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 PRELPP51888 382 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 SLC12A3P55017 1021 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TRIM14Q14142 442 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 MCTP2Q6DN12 878 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 A0A1W2PQC6 194 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 ABL1P00519 1130 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 ASNSP08243 561 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 POLD1P28340 1107 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 POLD4Q9HCU8 107 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TBX3O15119 743 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 MAP3K10Q02779 954 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 CYP3A4P08684 503 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 POLR2MP0CAP2 368 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 LDHDQ86WU2 507 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.18■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 CLCN6P51797 869 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 PSMD2Q13200 908 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 RGL1Q9NZL6 768 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 URI1O94763 535 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TNIP1Q15025 636 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 FAM20AQ96MK3 541 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 MICALL2Q8IY33 904 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 SH2D4AQ9H788 454 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 FEM1BQ9UK73 627 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 RPA1P27694 616 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 MTFR1LQ9H019 292 aa25.16■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 CHMP2AO43633 222 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TUBB4AP04350 444 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 FAM160B2Q86V87 743 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 WDR59Q6PJI9 974 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 ERMNQ8TAM6 284 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 LRRC63Q05C16 580 aa25.14■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.14■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 FZD1Q9UP38 647 aa25.14■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
LRRC1-203ENST00000487251 PTGER2P43116 358 aa25.14■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 CASP5P51878 434 aa25.14■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.14■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.14■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 ZNF536O15090 1300 aa25.14■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 VGLL3A8MV65 326 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 CASQ1P31415 396 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 DNAJC7Q99615 494 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 HACL1Q9UJ83 578 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 DNM3Q9UQ16 869 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 PLA2G6O60733 806 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 CYP2C19P33261 490 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 PLA2G4AP47712 749 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 GIT2Q14161 759 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 VWA3BQ502W6 1294 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 REEP2Q9BRK0 252 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC1-203ENST00000487251 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms