RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 P2RX5Q93086 422 aa8.52□□□□□ -1.05
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CASQ1-203ENST00000481081 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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CASQ1-203ENST00000481081 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.49□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 IWS1Q96ST2 819 aa8.49□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.49□□□□□ -1.05
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CASQ1-203ENST00000481081 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.49□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 PNMA2Q9UL42 364 aa8.49□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 MTMR7Q9Y216 660 aa8.49□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 M0R2C6 588 aa8.48□□□□□ -1.05
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CASQ1-203ENST00000481081 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.48□□□□□ -1.05
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CASQ1-203ENST00000481081 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 TSPY2A6NKD2 308 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 PER2O15055 1255 aa8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CASQ1-203ENST00000481081 PI15O43692 258 aa8.47□□□□□ -1.05
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