RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479535.2

SYCE1-205, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYCE1, Length 2,479 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-205ENST00000479535 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TBC1D5Q92609 795 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 GOLGA1Q92805 767 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PIK3CDO00329 1044 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 KCNA3P22001 575 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 RPA1P27694 616 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 KRT83P78385 493 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ERMNQ8TAM6 284 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FAM20AQ96MK3 541 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.87□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PSME4Q14997 1843 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 RCCD1A6NED2 376 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CFBP00751 764 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 DPEP1P16444 411 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CHMP4BP1P59074 171 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CYP4A11Q02928 519 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC174Q6PII3 467 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 GOPCQ9HD26 462 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 VAV3Q9UKW4 847 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF76P36508 570 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CYP27A1Q02318 531 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 KIAA1328Q86T90 577 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 RABGGTAQ92696 567 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 IQCDQ96DY2 449 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 DNM3Q9UQ16 869 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.86□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CYP3A4P08684 503 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CDK17Q00537 523 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 GIT2Q14161 759 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CEP112Q8N8E3 955 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 EML1O00423 815 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF263O14978 683 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CASP5P51878 434 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 AMPD2Q01433 879 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 KCNMA1Q12791 1236 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TUBB2AQ13885 445 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 POTEAQ6S8J7 498 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.85□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ENC1O14682 589 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC42Q96M95 316 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 CEP63Q96MT8 703 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 REEP2Q9BRK0 252 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 WDR18Q9BV38 432 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 VCPKMTQ9H867 229 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 RGL1Q9NZL6 768 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 LRRC53A6NM62 1247 aa14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SYCE1-205ENST00000479535 RRAGAQ7L523 313 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms