RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RCCD1A6NED2 376 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WNT10BO00744 389 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP3A7P24462 503 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLCN6P51797 869 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NIM1KQ8IY84 436 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WDR18Q9BV38 432 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POLD1P28340 1107 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC12A3P55017 1021 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FEZ1Q99689 392 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FZD1Q9UP38 647 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HYIQ5T013 277 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CPXCR1Q8N123 301 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MBOAT7Q96N66 472 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSMD1Q99460 953 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TSG101Q99816 390 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 REEP2Q9BRK0 252 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOPCQ9HD26 462 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRRC63Q05C16 580 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAN2A1Q16706 1144 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RRAGAQ7L523 313 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIAA1328Q86T90 577 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SFR1Q86XK3 245 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TPH2Q8IWU9 490 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.04□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CTAGE9A4FU28 777 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP1R2P41236 205 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZBED6P86452 979 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNA1Q09470 495 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SEMA3FQ13275 785 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VCPKMTQ9H867 229 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VAV3Q9UKW4 847 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNM3Q9UQ16 869 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRGAP2O75044 1071 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYBP10242 640 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 INPP5BP32019 993 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAP2P40123 477 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GIT2Q14161 759 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q4G0T1 1027 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABCB11O95342 1321 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRRC53A6NM62 1247 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF263O14978 683 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSMD2Q13200 908 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RASA3Q14644 834 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KSR1Q8IVT5 923 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ST7Q9NRC1 585 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.02□□□□□ -0.16
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POLR2MP0CAP2 368 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPA1P27694 616 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNMA1Q12791 1236 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERMNQ8TAM6 284 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARP10275 920 aa14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms