RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 NCK2O43639 380 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 HSF2BPO75031 334 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 LSP1P33241 339 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 PRPHP41219 470 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 KCNB1Q14721 858 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC96Q2M329 555 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC114Q96M63 670 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ECE2O60344 883 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 MASTLQ96GX5 879 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 SGSM3Q96HU1 749 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 H0YIN7 160 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ZBTB7AO95365 584 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 MOCS3O95396 460 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 MYL1P05976 194 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 BIRC2Q13490 618 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ZIM3Q96PE6 472 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 KLRC4O43908 158 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 NAA25Q14CX7 972 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 SMCO2A6NFE2 343 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 E7EVH7 732 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 BACH1O14867 736 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 PLSCR1O15162 318 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 EPHB6O15197 1021 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CRKP46108 304 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 KRT83P78385 493 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 20.4
ZBED1-201ENST00000381218 LETM2Q2VYF4 491 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CABP7Q86V35 215 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CREG2Q8IUH2 290 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 RNF217Q8TC41 542 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 DNAJC18Q9H819 358 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 VCPKMTQ9H867 229 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 C6orf50Q9HD87 102 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 PSMA7O14818 248 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 RHOBTB3O94955 611 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 OR52Z1P0C646 297 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 FCER1AP12319 257 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 SLC15A2Q16348 729 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 SOGA3Q5TF21 947 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 MICALCLQ6ZW33 695 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 COA1Q9GZY4 146 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 EXOC1Q9NV70 894 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ESYT3A0FGR9 886 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 PLCG2P16885 1265 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 PLCG1P19174 1290 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 GNA11P29992 359 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 KIF5AQ12840 1032 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 UBE2SQ16763 222 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 ANKRD40Q6AI12 368 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 TTI2Q6NXR4 508 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 AK8Q96MA6 479 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 CUEDC2Q9H467 287 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-201ENST00000381218 THAP9Q9H5L6 903 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms