RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PGBD4Q96DM1 585 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 KCND1Q9NSA2 647 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 GGA3Q9NZ52 723 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 A6NHS1 94 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM64BA6NI03 449 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SFI1A8K8P3 1242 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 LACTBL1A8MY62 500 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM232C9JQI7 657 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TMCC1O94876 653 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SKIP12755 728 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 CCT5P48643 541 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 LRMPQ12912 555 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 DPYSQ14117 519 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF12Q16514 161 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 BEND5Q7L4P6 421 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TEKT4Q8WW24 435 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 OPTNQ96CV9 577 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM107BQ9H098 131 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 EPC1Q9H2F5 836 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 GMEB1Q9Y692 573 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PEAK1Q9H792 1746 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SLIT3O75094 1523 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 STMND1H3BQB6 276 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 DIAPH2O60879 1101 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TNNI2P48788 182 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 NUBP1P53384 320 aa7.48□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 NFIAQ12857 509 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 STK32AQ8WU08 396 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 GATAD2AQ86YP4 633 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 NDNQ99608 321 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 DESI2Q9BSY9 194 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF112Q9ULX5 631 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 DGKIO75912 1065 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 AGR2O95994 175 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 IDO1P14902 403 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SYT1P21579 422 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R2P41236 205 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 POTEDQ86YR6 584 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.211e-6■■□□□ 14.5
RABGEF1-202ENST00000380828 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL2A1Q16548 175 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 FUT8Q9BYC5 575 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 GMNNO75496 209 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 GAKO14976 1311 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXP2O15409 715 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 ZSCAN12O43309 604 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 ORC4O43929 436 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 RASSF9O75901 435 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PYGMP11217 842 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFAIP3P21580 790 aa7.46□□□□□ -1.21
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