RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.12■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 POLR2MP0CAP2 368 aa24.12■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.12■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.12■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP25P42331 645 aa24.11■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 ARSHQ5FYA8 562 aa24.11■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.11■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 VAV3Q9UKW4 847 aa24.11■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.11■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.11■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 FEM1BQ9UK73 627 aa24.11■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 TRAF5O00463 557 aa24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 WNT10BO00744 389 aa24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 MAP3K10Q02779 954 aa24.1■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.1■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.1■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 KRT83P78385 493 aa24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.1■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 CTAGE9A4FU28 777 aa24.09■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 TGFB2P61812 414 aa24.09■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 CDK17Q00537 523 aa24.09■■□□□ 1.45
SPHK1-201ENST00000323374 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.452e-6■■■■□ 19.6
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SPHK1-201ENST00000323374 GNA14O95837 355 aa24.08■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.08■■□□□ 1.45
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SPHK1-201ENST00000323374 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.08■■□□□ 1.44
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SPHK1-201ENST00000323374 HERVK_113P62684 666 aa24.05■■□□□ 1.44
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SPHK1-201ENST00000323374 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.05■■□□□ 1.44
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SPHK1-201ENST00000323374 EYA4O95677 639 aa24.05■■□□□ 1.44
SPHK1-201ENST00000323374 LRCH2Q5VUJ6 765 aa24.05■■□□□ 1.44
SPHK1-201ENST00000323374 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.05■■□□□ 1.44
SPHK1-201ENST00000323374 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.05■■□□□ 1.44
SPHK1-201ENST00000323374 PSMD10O75832 226 aa24.04■■□□□ 1.44
SPHK1-201ENST00000323374 ERCC3P19447 782 aa24.04■■□□□ 1.44
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