RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297615.9

TTC39B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 39B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TTC39B, Length 3,053 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39B-201ENST00000297615 MOCS3O95396 460 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 EPS15P42566 896 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 RAD54LQ92698 747 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 BMP3P12645 472 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 DPEP1P16444 411 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 RASSF7Q02833 373 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 LRRC53A6NM62 1247 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 MEIS2O14770 477 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 DNM2P50570 870 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 CCDC51Q96ER9 411 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 NDST4Q9H3R1 872 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 USP20Q9Y2K6 914 aa14.98□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 MYBP10242 640 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 SLC7A5Q01650 507 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 SPA17Q15506 151 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 ERLIN1O75477 346 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 SFR1Q86XK3 245 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 BANK1Q8NDB2 785 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 RAB34Q9BZG1 259 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 TISP43B9A030 160 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 GCNT3O95395 438 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 CASP4P49662 377 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 MIIPQ5JXC2 388 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 CCDC151A5D8V7 595 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 KRT86O43790 486 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 KIF5AQ12840 1032 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 COG2Q14746 738 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 AMNQ9BXJ7 453 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF263O14978 683 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ADAM9Q13443 819 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 POTEAQ6S8J7 498 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 LRRN2O75325 713 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ALAS1P13196 640 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 TRIM14Q14142 442 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CASP8Q14790 479 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 THAP9Q9H5L6 903 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 SCN7AQ01118 1682 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 BICDL2A1A5D9 508 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CCDC66A2RUB6 948 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CYP2J2P51589 502 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 GALNT17Q6IS24 598 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 HDXQ7Z353 690 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 MS4A14Q96JA4 679 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ABCB11O95342 1321 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 SLC9A1P19634 815 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TTC39B-201ENST00000297615 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms