RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100237.3

Ttf1-201, Transcript of Transcription termination factor 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ttf1, Length 4,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Atp6v0a4Q920R6 833 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Adarb2Q9JI20 745 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Casp12O08736 419 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ccng2O08918 344 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc4a1P04919 929 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Krt8P11679 490 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mdh1P14152 334 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc7a1Q09143 622 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gspt2Q149F3 632 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Map3k12Q60700 888 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Krt14Q61781 484 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc51bQ80WK2 128 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 D130040H23RikQ8BII3 405 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rcor2Q8C796 523 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Usp27Q8CEG8 438 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 DpydQ8CHR6 1025 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ces1dQ8VCT4 565 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Apopt1Q9CQW7 192 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mfap3lQ9D3X9 409 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 CsadQ9DBE0 493 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 RabggtaQ9JHK4 567 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Adamts7Q68SA9 1657 aa7.5□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 1700018F24RikB2RW27 314 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tex13cD3YU32 604 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ccdc170D3YXL0 722 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pbx2O35984 430 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rrm1P07742 792 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Atp8b1Q148W0 1251 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Q3UK37 420 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Klra8Q60682 266 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rasa3Q60790 834 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 EsrrbQ61539 433 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Retreg2Q6NS82 541 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Enox2Q8R0Z2 598 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tfap4Q9JIZ5 338 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Grin2dQ03391 1323 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Krt78E9Q0F0 1068 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Phldb3E9QAF4 648 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nhej1Q3KNJ2 295 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ankrd13cQ3UX43 541 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Krt87Q6IMF0 495 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 PicalmQ7M6Y3 660 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cct8l1Q80YT3 562 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Bbs9Q811G0 885 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 4921504E06RikQ8CET2 560 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Bst2Q8R2Q8 172 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfp617Q91WM0 559 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Myl7Q9QVP4 175 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rhox13F6YCR7 232 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pla2g4bP0C871 782 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 StamP70297 548 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tex11Q14AT2 947 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fam178bQ24JP3 464 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Susd4Q8BH32 490 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tmem87aQ8BXN9 555 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Riox2Q8CD15 465 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 GlyctkQ8QZY2 523 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Capn12Q9ER56 720 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Large1Q9Z1M7 756 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Surf6P70279 355 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Spata18Q0P557 537 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm5592Q3V0A6 857 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Madcam1Q61826 405 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Anks6Q6GQX6 883 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 SpopQ6ZWS8 374 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 SncbQ91ZZ3 133 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ndufb5Q9CQH3 189 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mcur1Q9CXD6 340 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 SyncQ9EPM5 470 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 PigoQ9JJI6 1093 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 GsdmeQ9Z2D3 512 aa7.49□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tldc2A2ACG1 198 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gpr161B2RPY5 545 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ppfia4B8QI36 1187 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Xirp1O70373 1129 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Irf1P15314 329 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nat2P50295 290 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 TchpQ3TVW5 497 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfyve27Q3TXX3 415 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Q3UJP5 209 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Znf652Q5DU09 608 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cct6bQ61390 531 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Map10Q8BJS7 891 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 OplahQ8K010 1288 aa7.48□□□□□ -1.21
Ttf1-201ENSMUST00000100237 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.2 ms