RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNB2	Q92953	911 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	RFX8	Q6ZV50	586 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	ERICH1	Q86X53	443 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	PANK4	Q9NVE7	773 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	SUPT3H	O75486	399 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	CTDNEP1	O95476	244 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	POLD1	P28340	1107 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	SCNN1B	P51168	640 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	WLS	Q5T9L3	541 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM87B	Q96K49	555 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	LGALS16	A8MUM7	142 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNQ3	O43525	872 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP6V1G1	O75348	118 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	ECEL1	O95672	775 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	TMTC2	Q8N394	836 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	MTR	Q99707	1265 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	PICK1	Q9NRD5	415 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	INTS13	Q9NVM9	706 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	DNM1L	O00429	736 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	GC	P02774	474 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	PTPRE	P23469	700 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	SH3GL2	Q99962	352 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM153B	P0C7A2	387 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	COPS2	P61201	443 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	IL9R	Q01113	521 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM153C	Q494X1	144 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	TBC1D5	Q92609	795 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	MIS12	Q9H081	205 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	CARD9	Q9H257	536 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	AMFR	Q9UKV5	643 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SPIN3-231	ENST00000639895	DNAJC6	O75061	913 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	SASH1	O94885	1247 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	HSD17B3	P37058	310 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBTB17	Q13105	803 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	PTGDR	Q13258	359 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895		Q4G0T1	1027 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	SYNC	Q9H7C4	482 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	GNAT2	P19087	354 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	ABCB4	P21439	1286 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	AGPS	O00116	658 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	MAPK13	O15264	365 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	TMCC1	O94876	653 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB27A	P51159	221 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM139	Q8IV31	216 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	TTC1	Q99614	292 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	PLVAP	Q9BX97	442 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	SNX24	Q9Y343	169 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	CPS1	P31327	1500 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	GLI1	P08151	1106 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	GRIK3	Q13003	919 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	LLGL1	Q15334	1064 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	APOA5	Q6Q788	366 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	TMC4	Q7Z404	712 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	RUBCN	Q92622	972 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	AMACR	Q9UHK6	382 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SPIN3-231	ENST00000639895	CETN2	P41208	172 aa		12.32	□□□□□ -0.44

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