RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 POLE2P56282 527 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 TMED2Q15363 201 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC4Q96A65 974 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 USP21Q9UK80 565 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 KDM5CP41229 1560 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 GFPT2O94808 682 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 MYL1P05976 194 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 IGBP1P78318 339 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 RCN2Q14257 317 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 MX2P20592 715 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 CLCN6P51797 869 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PBKQ96KB5 322 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 ANAPC5Q9UJX4 755 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PDE1BQ01064 536 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 OSBP2Q969R2 916 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 NNTQ13423 1086 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 ERVK-7P63135 1459 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 XDHP47989 1333 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 APBA3O96018 575 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 CDC25AP30304 524 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PANX2Q96RD6 677 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 GCNT4Q9P109 453 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 PRPSAP1Q14558 356 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 MEIS1O00470 390 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SLC16A2P36021 539 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ASPHQ12797 758 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 HDAC11Q96DB2 347 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 LRGUKQ96M69 825 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SMYD2Q9NRG4 433 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PNMA2Q9UL42 364 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 EVI5O60447 810 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA10O95299 355 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF15Q66K64 600 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SCOCQ9UIL1 159 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SERPING1P05155 500 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ZBED6P86452 979 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TAF11Q15544 211 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PI16Q6UXB8 463 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC68Q9H2F9 335 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 RAPH1Q70E73 1250 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 RNF14Q9UBS8 474 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 KRT1P04264 644 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC17Q96LX7 622 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TFDP1Q14186 410 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ICE2Q659A1 982 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 COA7Q96BR5 231 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 IFNAR1P17181 557 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 MSH2P43246 934 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TMED1Q13445 227 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PLCB4Q15147 1175 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC151A5D8V7 595 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PLCG1P19174 1290 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 CCNE1P24864 410 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF521Q96K83 1311 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 PFDN6O15212 129 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-211ENST00000580170 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms