RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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CAPN3-210ENST00000561817 MED15Q96RN5 788 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPN3-210ENST00000561817 ANO3Q9BYT9 981 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPN3-210ENST00000561817 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPN3-210ENST00000561817 ANKRD62A6NC57 917 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPN3-210ENST00000561817 POTECB2RU33 542 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPN3-210ENST00000561817 BIN1O00499 593 aa7.37□□□□□ -1.23
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