RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517173.1

RN7SKP234-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 234, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP234, Length 224 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP234-201ENST00000517173 SMARCA1P28370 1054 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 GPR85P60893 370 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ICA1Q05084 483 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 BLMHQ13867 455 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 CCDC38Q502W7 563 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 RNF220Q5VTB9 566 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TTLL7Q6ZT98 887 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 LMBR1Q8WVP7 490 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 KIAA1191Q96A73 305 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 FAM170AA1A519 330 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TTLL8A6PVC2 850 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TGM5O43548 720 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 B3GALT2O43825 422 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 MAFKO60675 156 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TMCC2O75069 709 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 CD4P01730 458 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 CD33P20138 364 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 EPHA1P21709 976 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 MAOBP27338 520 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 SLC19A1P41440 591 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 APBA1Q02410 837 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 RING1Q06587 406 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 FOXC1Q12948 553 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 PAK1Q13153 545 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 PPP2R5DQ14738 602 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TAF11Q15544 211 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ANO4Q32M45 955 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 CREB3L3Q68CJ9 461 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 FAM35AQ86V20 835 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 HID1Q8IV36 788 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 MVB12AQ96EY5 273 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ALG1Q9BT22 464 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 CENPOQ9BU64 300 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 L1RE1Q9UN81 338 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 FHOD1Q9Y613 1164 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ERBB4Q15303 1308 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 EYA2O00167 538 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 FANCGO15287 622 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 MGEA5O60502 916 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 UBXN7O94888 489 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 CPB1P15086 417 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 POLD1P28340 1107 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 LSP1P33241 339 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 PIK3CBP42338 1070 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ARL4DP49703 201 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ZNF445P59923 1031 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 PHC1P78364 1004 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ZBED6P86452 979 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 AMPD2Q01433 879 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 NBPF8Q3BBV2 869 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 PPM1JQ5JR12 505 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP234-201ENST00000517173 C6orf118Q5T5N4 469 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms