RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 STAT3P40763 770 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 IL23RQ5VWK5 629 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 USP38Q8NB14 1042 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PEX13Q92968 403 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NUF2Q9BZD4 464 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.74□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 TRIM64BA6NI03 449 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 E9PMD0 336 aa6.74□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 FAM107AO95990 144 aa6.74□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 SP140Q13342 867 aa6.74□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 INSCQ1MX18 579 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.74□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 IFNL1Q8IU54 200 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 USP16Q9Y5T5 823 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 REREQ9P2R6 1566 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 IDH3BO43837 385 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CUTAO60888 179 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GNA14O95837 355 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 KCNA6P17658 529 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ATP6V1C1P21283 382 aa6.73□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 ADCY8P40145 1251 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MAP3K12Q12852 859 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GNA13Q14344 377 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PSMD6Q15008 389 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ADRM1Q16186 407 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ME3Q16798 604 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 AADATQ8N5Z0 425 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC63Q8NA47 563 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 COG1Q8WTW3 980 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 STARD8Q92502 1023 aa6.73□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 NDST4Q9H3R1 872 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HYPKQ9NX55 129 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC42Q9Y546 428 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NSD2O96028 1365 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 STRNO43815 780 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HSD17B7P56937 341 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 POU5F1BQ06416 359 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SPATA1Q5VX52 437 aa6.73□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 CORO6Q6QEF8 472 aa6.73□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 POLG2Q9UHN1 485 aa6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 DSEQ9UL01 958 aa6.73□□□□□ -1.33
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PDE4D-216ENST00000507116 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 E7ENQ6 273 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 WNT7AO00755 349 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CPLX1O14810 134 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RASA4O43374 803 aa6.72□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ACSL4O60488 711 aa6.72□□□□□ -1.33
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