RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 STEAP3Q658P3 488 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 C1orf159Q96HA4 380 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 LNPKQ9C0E8 428 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.67□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 A0A1W2PQU0 124 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 K7ESM1 405 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 DGKIO75912 1065 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 RGL3Q3MIN7 710 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 USP53Q70EK8 1073 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 IER2Q9BTL4 223 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 ADRB1P08588 477 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 GRIA2P42262 883 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 SPATS1Q496A3 300 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 EMC4Q5J8M3 183 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 FAM124AQ86V42 546 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2B-202ENST00000499038 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 MAFKO60675 156 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 CR1LQ2VPA4 569 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 MCTP2Q6DN12 878 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 BORAQ6PGQ7 559 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 BORCS6Q96GS4 357 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 DTLQ9NZJ0 730 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 MYOTQ9UBF9 498 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.64□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 KRIT1O00522 736 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 EFEMP1Q12805 493 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 SGSM3Q96HU1 749 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 GPR27Q9NS67 375 aa6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 DLX3O60479 287 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 TADA3O75528 432 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 ADAM9Q13443 819 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF827Q17R98 1081 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.62□□□□□ -1.35
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UBE2B-202ENST00000499038 MROH6A6NGR9 719 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 PRODHO43272 600 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 KLF4O43474 513 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 CYP7B1O75881 506 aa6.61□□□□□ -1.35
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UBE2B-202ENST00000499038 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 TEPPQ6URK8 271 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 LGI4Q8N135 537 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 WRNIP1Q96S55 665 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 JAM3Q9BX67 310 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.61□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 MSCO60682 206 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 NFKB2Q00653 900 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 PRR31Q5SQ13 230 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM209Q96SK2 561 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 CROTQ9UKG9 612 aa6.6□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF536O15090 1300 aa6.59□□□□□ -1.35
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UBE2B-202ENST00000499038 ITGB3P05106 788 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 FGFR1P11362 822 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF28P17035 718 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 RAB33AQ14088 237 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 KIZQ2M2Z5 673 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 NSMFQ6X4W1 530 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 DCAF4Q8WV16 495 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 INVSQ9Y283 1065 aa6.59□□□□□ -1.35
UBE2B-202ENST00000499038 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.58□□□□□ -1.36
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